De bibliotheek van het museum biedt een uitgebreide en unieke collectie literatuur over de Nederlandse noordzeevisserij en voormalige zuiderzeevisserij.
De bibliotheekcollectie omvat (maritieme) overzichtswerken, rapporten, monografieën, artikelen en afgesloten en lopende tijdschriften, jaarboeken en verslagen.
Op zoek naar de herkomst of geschiedenis van een visserijschip? Het Centraal Visserijregister (vanaf 1911), het fotoarchief en de collectie technische tekeningen bieden uitkomst.
Raadpleeg de collectie via http://www.maritiemdigitaal.nl/
De bibliotheek is met ingang van 1 september 2010 gesloten voor publiek. Gedurende de sluiting is de dienstverlening beperkt.